水稻数据库使用教程视频,水稻信息网

2023年11月7日13:10:58 发表评论 0

怎么从国家水稻数据中心下载DNA序列

1、进入这个网站:http:// 选择你想下载的 点进去,下载 水稻(Oryza sativa L.)是最重要粮食作物之一,也是世界1/2以上人口的主食,与其相关的遗传学和分子生物学研究一直倍受研究者的重视。

2、这是韩国水稻基因组数据库的网站。该数据库由韩国明治大学生物科学系维护,韩国国家农业科技研究所支持。

3、分别是基因组序列和CDS(mRNA)序列。

4、打开NCBI 百度搜索键入“NCBI”,点击“搜索”,第一个就是官方主页,点击打开。关键字查找 以H9亚型流感病毒HA基因下载为例,说明详细过程。

5、NCBI上下载基因序列、 mRNA、CDS序列的方法打开,打开NCBI网站,第一个框选择 Gene,第二个框输入基因名称,如ALK基因,点击 Search。

如何下载水稻基因组全序列?

进入这个网站:http:// 选择你想下载的 点进去,下载 水稻(Oryza sativa L.)是最重要粮食作物之一,也是世界1/2以上人口的主食,与其相关的遗传学和分子生物学研究一直倍受研究者的重视。

INE基因组数据库(整合的水稻基因组浏览器)整合了迄今为止已累计的水稻基因组信息,并且把它们与基因组序列相关联。

首先利用RM71与RM58之间已公布的大号分子标记进行定位研究。其次从RGP据库获得fp基因区域的局部物理图谱并下载其中的Contig完整序列,根据相应物理区段内水稻碱基序列开发新的SSR标记和InDel标记进行fp基因的精细定位。

方法如下:进入这个网站。选择你想下载的。点进去,下载就可以了还是比较简单。

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如何获得水稻的cdna序列

首先需要获得水稻Ostf1基因的cDNA序列,可以通过NCBI数据库或其他公开的基因库进行检索和下载。

首先,需要从耐盐植物中克隆出目标基因。可以通过PCR扩增、cDNA文库筛选等方法,从植物组织中提取目标基因的DNA序列。将目标基因插入适当的载体中。

打开NCBI网站,选择“blast”链接。 在“blast”页面上,选择“Nucleotide BLAST”选项。

人工合成主要是通过DNA自动合成仪,通过固相亚磷酸酰胺法合成,具体过程可以网上查询,反正是可以按照已知序列将核苷酸一个一个连接上去成为核苷酸序列,一般适于分子较小而不易获得的基因。

点击进入序列文件查看详情,以上图搜索结果18为例,点开后界面如下 向下找到cds标签 点击CDS跳出如下界面 棕色标记的序列就是cDNA序列,旁边有对应的氨基酸序列。如果搜索结果太多,可以在检索结果中按物种筛选,如下图红框。

科学家运用独创的基因分离技术已成功地获取近两千条水稻cDNA片段,并研制出国内第一张功能独特的水稻基因芯片。


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